Na sequência da entrega da DAV será emitida a nota de liquidação do ISV. Caso entregue a DAV no Portal das Finanças, deverá no mesmo Portal solicitar a emissão do Documento Único de Cobrança para pagar o ISV. Este imposto deverá ser pago no prazo de 10 dias após a emissão da DAV e da nota de liquidação. De notar que atualmente existe a possibilidade de requerer, em alternativa, o método de avaliação para calcular o ISV. O pedido do método de avaliação será analisado pela alfandega e, em determinados casos, será solicitada a vistoria do veículo pela alfandega. O pedido de aplicação do método de avaliação está sujeito ao pagamento prévio de uma taxa variável entre 150 Euros a 300 Euros (dependendo se é necessário realizar a vistoria física do veículo).
Apenas é sujeito a IVA (1) os veículos adquiridos há menos de 6 meses ou com menos de 6 mil quilómetros; ou (2) importados fora da União Europeia.